弯道超车，解决生猪种业“卡脖子”难题 广东省举办猪基因组选择育种技术培训班

11月1日，由广东省农业农村厅主办，广东省农业技术推广中心承办的2021年猪基因组选择育种技术培训班在广州浙江大厦举办，省农业农村厅种业管理处刘中国处长、省农业技术推广中心陈三有副主任出席开班式，培训班邀请了中山大学、中国农业大学、华南农业大学等高校科研单位的专家授课，温氏股份、东瑞股份、广弘控股等国家生猪核心育种场和省内育种基础较好的种猪场育种技术员共计81人参加。

2021年猪基因组选择育种技术培训班现场

广东省农业农村厅种业管理处刘中国处长讲话

开班式上，刘中国处长介绍了广东省在畜禽种业资源、科研领域、政策层面等方面的优势，提出要前瞻布局、系统谋划、把握主动，坚持立足省内、自主创新、提质保供的发展战略，着力做强做大做优广东生猪种业。

中国农业大学刘剑锋教授

刘剑锋教授通过腾讯会议远程为学员讲授《自动化基因组遗传评估初步实现策略》，讲述了基因组选择的基本原理、目的和意义，重点介绍了育种企业使用全国畜牧综合信息平台的操作流程和注意事项。他指出通过基因组选择技术，可以实现对候选群体（仅有基因型，没有表型个体）的遗传评估，相比传统的选择策略全基因组选择具有明显的优势，ssBLUP（一步法）更好地和常规育种相结合，是目前我国生猪遗传改良计划推荐的基因组育种值评估的标准方法。

中山大学刘小红研究员

刘小红研究员就《生猪产业化之育种体系建设》展开探讨，他指出，受非洲猪瘟的影响，我国养猪业面临着种猪健康保障、调猪向调肉等诸多挑战，中大型养殖企业普遍采用闭群式生产体系。面对新形势，育种工作应相应作出三点改变：一是育种目标向消费者转移；二是建立非接触式智能化测定方法；三是构建全产业链育种体系。随着环境的改善和疾病控制能力的加强，育种工作成为企业创造明天竞争力的核心基础，构建持续选育提高的育种体系是关键。新形势下育种体系的建设前提是统一 阶级育种平台，在此基础上围绕选种选配、效果评价、育种目标、遗传评估、性能测定、繁育体系六大要素开展工作。未来动物遗传育种将结合跨场间的表型性能测定信息、基因组信息开展联合遗传评估，旨在选择出在多区域、多场表现优秀的顶级种猪。刘小红研究员强调，育种企业要结合市场需求和企业发展方向，合理制定育种规划；加大新技术的应用，新技术的合理应用，加快遗传进展和新品系培育效率；企业要保持持续稳定的资金、人力、物力投入，这是持续开展种猪选育的重要保障；建立结构合理、专业素养高、执行力强的育种团队。

华南农业大学蔡更元研究员

蔡更元研究员对《种猪全基因组选择技术及其育种实践》进行全面地讲解，对全基因组选择技术概念、流程、优势等作了介绍，他表示改良种猪的方式是“选择”，全基因组选择技术是新一代分子育种技术，可实现种猪早期选种，准确性更高，对产仔数等性状选择效果好，而种猪全基因组选择技术的“卡脖子”问题在于基因分型方法，近年来基因分型技术也得到了一定的发展，自2010年以来，先后建立了基于基因芯片、简化基因组测序、全基因组测序的种猪全基因组选择技术。蔡更元研究员还介绍了三代基因组分型技术，第一代自主创制专用SNP芯片、第二代简化基因组测序技术（ GBS ）、第三代基于全基因组测序的基因组选择技术研究，并结合温氏种猪基因组育种管理软件的实际应用情况，分享了温氏应用效果，为其他育种企业在全基因组选择技术的使用上提供了好的经验。

华南农业大学张哲教授

张哲教授介绍了《猪基因组遗传评估的原理和方法》，对比了常规方法与基因组选择方法，他表示基因组选择具有更高的选择准确性、早期选择缩短世代间隔、能提高选择强度、大幅度提高育种进展、对传统选择方法受限的性状更具优势更具优势；介绍了遗传评估原理与方法，列举了基因组评估计算的实际案例，分析育种工作的成效。他强调基因组选择已验证成熟，优于传统方法，能有效提高育种收益，已在奶牛育种中常规应用，应用于猪、鸡育种是必然方向，各企业按实际情况制定实施方案，可保障应用效果。

广东省种猪联合育种工程技术研究中心王希斌副主任

王希斌副主任对《基于基因组平台定制化育种模型应用》作了详细的讲解，重点介绍了基因组分析基础与应用，包括GS选育的主要流程、全基因组选育应用、猪基因组选育落地应用、猪基因组选育评估应用等内容，介绍了广东省遗传评估中心系统操作方法，包括育种平台数据上报，基因组数据上传，育种平台数据自动处理等具体的操作方法，同时分析了基于基因组平台的定制化育种模型。

北京康普森农业科技有限公司首席数据分析师邓飞

邓飞老师对《基于大数据的种猪育种策略》展开分享，详细介绍了康普森GS流程，包括基因组选择的流程、方法，从重复样本检验及去除、亲子鉴定及系谱纠偏、半同胞全同胞检验、离群样本检验、群体结构异常、GS模型遗传参数异常等方面分享了康普森GS经验，强调了多场联合分析注意事项，他指出CR是衡量群体关联稳健而可靠的评价指标，猪常规联合评估的前提是种猪场之间存在一定的遗传关联，当场间关联率（CR）不低于3%时，联合评估的结果才较为准确，否则建议单场进行遗传评估。

广东省农业技术推广中心谢水华博士

谢水华博士对广东省猪基因组选择与联合育种技术推广应用工作进行了回顾，从政策导向、财政支持情况、技术趋势等方面介绍了项目实施的背景，讲述了项目实施内容，包括指导省内国家生猪核心育种场和育种基础较好具备申报国家生猪核心育种场（种公猪站）条件的原种猪场（种公猪站）开展种猪登记和生长性能测定，建设基因组育种参考群，构建联合育种平台（广东省种猪遗传评估中心），指导企业制定基因组育种方案，举办专家座谈会、技术员培训班，制作宣传视频，组织专家团队“一对一”到场服务等。目前，广东省已经有10家企业开展了基因组选择育种工作，建设了9363头（不含温氏）种猪的参考群，基因检测数据初步用于早期选种，取得了较好的效果。今后，省农业技术推广中心将继续推动参考群的建设，增加数量，提高质量，与芯片检测公司合作开发低密度液态芯片，降低成本，加快基因组选择育种技术落地应用。

合影